Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HELTA6NFD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms