Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT1A5YKK6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT1A5YKK6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT1A5YKK6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms