Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF27A3QJZ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF27A3QJZ7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF27A3QJZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms