Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC144AA2RUR9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC144AA2RUR9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC144AA2RUR9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms