Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX2A2RU54 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX2A2RU54 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HMX2A2RU54 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms