Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQF6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQF6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A1W2PQF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1W2PQF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms