Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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