Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PHF8Q9UPP1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms