Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSEQ9UL01 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms