Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TUBE1Q9UJT0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms