Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RIMS3Q9UJD0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms