Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM5BQ9UGL1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM5BQ9UGL1 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms