Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms