Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SLC6A20Q9NP91 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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