Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZCCHC17Q9NP64 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms