Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AMBRA1Q9C0C7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms