Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSDMCQ9BYG8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms