Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TDRD1Q9BXT4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TDRD1Q9BXT4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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