Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
RETNLBQ9BQ08 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms