Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NUP88Q99567 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms