Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDRT15Q96T59 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms