Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ZNF479Q96JC4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms