Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLIP3Q96DZ5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms