Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG4Q92954 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG4Q92954 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms