Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGGTAQ92696 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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RABGGTAQ92696 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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RABGGTAQ92696 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RABGGTAQ92696 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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