Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHTF2Q8N3S3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHTF2Q8N3S3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms