Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNTD2Q8IXW0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms