Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PLD3Q8IV08 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 509.2 ms