Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00299Q6ZSB3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00299Q6ZSB3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms