Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD40Q6AI12 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD40Q6AI12 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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