Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FAM208BQ5VWN6 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms