Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
STRIP1Q5VSL9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms