Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LGSNQ5TDP6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms