Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDZK1Q5T2W1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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PDZK1Q5T2W1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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