Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
EDRF1Q3B7T1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms