Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UVSSAQ2YD98 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UVSSAQ2YD98 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms