Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTPRNQ16849 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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PTPRNQ16849 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PTPRNQ16849 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRNQ16849 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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