Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PDK4Q16654 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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