Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RPE65Q16518 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RPE65Q16518 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RPE65Q16518 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RPE65Q16518 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms