Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ZIC1Q15915 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms