Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NEDD8Q15843 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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NEDD8Q15843 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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NEDD8Q15843 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NEDD8Q15843 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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