Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA6Q15825 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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