Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIP13Q15645 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIP13Q15645 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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