Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NCAPHQ15003 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCAPHQ15003 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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