Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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