Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPRCAPQ14761 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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