Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHROOM2Q13796 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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