Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCOA4Q13772 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCOA4Q13772 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms