Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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TUBA3CQ13748 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TUBA3CQ13748 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TUBA3CQ13748 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TUBA3CQ13748 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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