Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEUROD1Q13562 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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